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bioinfo:oneliners

Ceci est une ancienne révision du document !


for filename in *.fa; do sed -i '/>Recurrent fasta name/c\>'$filename'' $filename; done

all VCF to vcf.gz

ls *.vcf | xargs -n1 -P0 bgzip

AWK

awk '{if(NR%4==2) {count++; bases += length} } END{print bases/count}' <fastq_file>
bioinfo/oneliners.1634029915.txt.gz · Dernière modification : 2021/10/12 11:11 de klorobionten