bioinfo:oneliners
Différences
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Ligne 1: | Ligne 1: | ||
+ | < | ||
for filename in *.fa; do sed -i '/> | for filename in *.fa; do sed -i '/> | ||
+ | </ | ||
+ | ==== all VCF to vcf.gz ==== | ||
- | = **all VCF to vcf.gz** = | + | < |
ls *.vcf | xargs -n1 -P0 bgzip | ls *.vcf | xargs -n1 -P0 bgzip | ||
+ | </ | ||
+ | |||
+ | ===== AWK ===== | ||
+ | < | ||
+ | awk ' | ||
+ | |||
+ | # keep online lines with col 5 & 4 of length == 1char | ||
+ | |||
+ | zgrep -v " | ||
+ | </ | ||
+ | |||
+ | Find last modified files from active directory. | ||
+ | < | ||
+ | find $1 -type f -exec stat --format '%Y :%y %n' " | ||
+ | </ |
bioinfo/oneliners.1631094448.txt.gz · Dernière modification : 2021/09/08 11:47 de klorobionten